無菌袋灌裝機，即在一個持續的無菌環境中進行的填充過程，故保持灌裝系統各環節的無菌狀態是本設備的關鍵因素，灌裝機的所有步驟，夾袋，夾蓋，拔蓋、旋蓋、灌裝、旋蓋、壓蓋等一系列動作都是在主機使用蒸汽噴射方法對無菌袋口和灌裝室進行殺菌后的無菌狀態下進行的，確保物料不與外部空氣接觸，達到無菌狀態。